一些用户在使用微耕机前会检查机身各处的螺丝是否拧紧，看螺丝松动就回去用力镶紧。其实这是错误的操作。有很多配件是铝合金的，而铝合金硬度不足，如果用力拧会造成拉丝。一些用户为了节省微耕机使用成本，使用价格低廉的劣质燃油，不仅使机器的动力不足，长此以往会加速油泵和芯套的磨损。同理劣质的润滑油也会缩短机器使用寿命。那些常见的“再生机油”一定不要乱用。微耕机各进油口、出油口的密封垫损坏后，重新安装时不注意位置摆放，造成密封效果差或堵塞进出口，轻则漏油，重则机油不流通使各曲轴、连轴得不到有效地润滑。
微耕机结构简单，防护措施少，工作环境恶劣，零部件互相摩擦振动以及油、泥、水的侵袭，不可避免的要造成零部件的磨损，连接松动、腐蚀老化。从而使微耕机技术状态变坏，功率下降，油耗增加，磨损加快，出现故障。若想拥有一个用的顺手的机器，必须把好机器保养关，严格执行“防重于治，养重于修“的维护保养制度，严格按照保养的周期和内容来进行。某村的刘某反映他的机器无力，烧机油，启动困难，拆开检查：发动机齿轮箱内的机油已成泥状，润滑不良；发动机的散热片通风孔全部堵塞，散热效果差；缸套、活塞严重磨损，动力不足。这是典型的保养不够造成的故障。
操作前期有三个准备工作,即选择配套的机器物具;检查传送箱、燃油箱、传送箱里的油料，和水箱中的水位:调整油门、离合器的拉线，还有手扶架高度、耕深和三角皮带等。在我们需要启动微耕机的时候，先在机启动前打开电锁,然后将档位调至空档,并且将水箱开关处调成滴水状态。接下来踩下启动阀，注意认真辨别发动机的运转声音和它排出的颜色，当操作人确定微耕机的发动机正常。