食品杀菌就是以食品原料、加工品为对象，通过对引起食品变质的主要因素---微生物的杀菌及，达到食品品质的稳定化，有效延长食品的保质期，并因此降低食品中有害细菌在存活数量，避免活菌的摄入引起人体肠道或预先在食品中产生的细菌导致人类生病。
食品杀菌有多种方式，高温杀菌、低温杀菌、巴氏杀菌、微波杀菌等。不同的食品需要不同的杀菌方式。
巴氏杀菌是对于要求对一些包装完毕的产品进行水浴灭苗而生产的一款灭菌设备，指温度比较低的热处理方式，一般在低于水沸点温度下进行，60-99°之间。它是一门古老的技术，至今仍有一定的应用价值。
巴氏杀菌工作原理是被包装好的产品放在可调速的不锈钢网带上，在传送带的作用下按序进入灭菌箱体内，经由高温水为介质杀菌后，再由传送带带入冷却箱体内均匀冷却，从而达到产品杀菌要求。
巴氏杀菌机是一种低温杀菌处理设备，低温杀菌是对食品中存在的微生物进行部分杀菌的加热方法，巴氏杀菌是指温度比较低的热处理方式，一般在低于水沸点温度下进行，既可以避免过热而造成的口味损失，又可以杀掉对人体有害的病菌。
水浴式巴氏杀菌机，主要用于真空软包装食品的杀菌工作，如果汁饮料、果冻、豆干、鸡爪等适用低温杀菌的食品，杀菌介质为水，真空包装好的产品被输送至调好温度的热水中进行杀菌处理，水温按工艺要求自由控制，输送电机变频控制，速度可调，杀菌后的产品输送至冷却段进行冷却处理，杀菌完成。
巴氏杀菌是一种低温杀菌处理方法，在低温下长时间或高温下短时间进行加热处理的一种方法。其中，在60℃以下加热30分钟的方式，作为低温灭菌的标准，早为世界广泛采用。巴氏杀菌营养破坏较少，但由于不能杀掉所有细菌，所以保质期相对也较短。
巴氏杀菌机以水为灭菌介质水浴式杀菌，以巴氏杀菌工艺为设备制造原理，通过杀菌后的食品，即能起到杀菌效果，又能保证蛋白质等营养成份不在较大温度范围内波动，保持食品原有的品质，达到对食品不加防腐剂和添加剂，而延长保质期，从而保护了人们的生命的健康。