有些大棚土壤沙性大，漏水漏肥的情况严重，因此粪肥应选择生物有机肥，这种粪肥纯度较高，养分含量也高，因为粪质比较黏重，对漏肥漏水的沙土地有良好的改良作用。湖北生物有机肥厂家指出，黏性土应施用有机质含量高而矿质元素含量少的粪肥，或者是含有沙子、稻壳、秸秆的鸡粪猪粪等，能够改善黏性土壤的物理性状，提高其透水透气能力。这样的粪肥也非常适合改良土壤盐渍化板结较为严重的棚室土壤。
堆肥是一种有机肥料，它是由各种各样的桔茎、叶子、草、动植物残馀、人和动物粪便、少量土壤混合而成。堆肥是用与堆肥相同的材料制成的，在淹水条件下进行发酵。粪便是指由猪、牛、马、羊、鸡、鸭等制成的粪便。沼气肥料是沼气的副产品，它是沼气在密封的沼气罐中分解有机物而产生的，包括沼气液体和残渣。
绿肥被栽培的或的绿色植物用作肥料。如绿豆、蚕豆、甜三叶草、大头菜、大头菜、紫花苜蓿、青菜等。非豆科绿肥包括黑麦草、大头菜、秋葵种子、河红、水葫芦、水花生等。
现在常见的枯草芽孢简单表示,其功能、类别众多,枯草芽孢单上有成百上千的来源肥料、饲料、、效果,我们必须使用孤立的从土壤中肥料生产的菌株代理他们脂肪枯草芽孢应用到土壤,对作物的影响差别非常大,这就是为什么一些细菌,效果不明显,这就是花粉枯草芽孢的生长过程中nystatin, gramicidin, hay rhzomorph, polymyxin，这些杀菌剂肥料的活性物质对内源染或机会原体具有良好的抑制作用。它可以与多种菌株混合，在农业生产中起着重要作用。